避難所はそれぞれの市区町村が独自で指定しているため、それらのデータが都道府県を通じて集約されるには時間がかかる（数か月～１年程度かかる場合もあります。）状況であり、一般的に全国の避難所を集約したデータベースは更新が遅い傾向があります。 災害時ナビで使用しているファーストメディア株式会社のサーバでも、基本的には都道府県で集約されたデータを使用しており、市区町村が指定する避難所情報がタイムリーに反映されていない場合があります。しかしながら、一部の自治体と提携することにより、提携自治体の避難所情報を随時得られる体制を整えており、日本で随一のデータ量・更新頻度を実現しています。今後、提携自治体は増加する見込みであり、最新のデータが得られる地域も広がる予定です。